三代测序技术（如Oxford Nanopore，简称ONT）凭借超长读长、无需PCR扩增及实时测序等核心优势，可直接对复杂环境样本中的微生物全DNA进行高通量测序，实现从物种水平到功能层面的全面解析。
不过当前三代宏基因组测序分析仍面临多重"卡脖子"挑战，包括原始数据体量大、碱基错误率高、分析算法不完善等问题，其中分箱重构高质量单菌基因组的环节尤为突出，如何得到更多更高质量的MAG始终是科研人员关注的核心问题。而利用传统的三种分箱策略仍未得到有效的解决。
针对该研究瓶颈，凌恩生物重磅推出三代宏基因组binning新策略——智能分箱算法LorBin！该工具由凌恩生物陶晔、钱俊博士参与研发，研究成果于2025年10月24日发表在国际权威期刊《Nature Communications》。
相较于现有工具，LorBin展现出显著优势：分箱质量大幅提升，对稀有物种的捕获能力显著增强——其重构的高质量宏基因组组装基因组（MAGs）数量较现有工具增长15%至189%，特有物种识别量更是达到其他工具的2.4至17倍。该工具兼具高运行效率、强可扩展性与易用特性，在32核CPU、64GB内存及0.3*NVIDIA A800 GPU的配置下，运行速度较SemiBin2、COMEBin等高性能工具快2.3至25.9倍。
展开剩余50%作为关键技术创新，LorBin不仅在基因组重构的质量与数量瓶颈上实现突破，更为新物种挖掘、致病菌及耐药基因等环境生物污染物的高效识别提供了核心技术支撑。
图1 LorBin在104个真实人类肠道宏基因组数据中，表现优于其他分类工具
图2 LorBin提高了新细菌物种的回收率
凌恩 生物紧跟CNS研究热潮，LorBin-三代宏基因组Binning流程最新策略已升级，助力客户探究科研奥秘，解锁高分科研文章！
参考文献
LorBin: Efficient binning of long-read metagenomes by multiscale adaptive clustering and evaluation. Nature Communications, 2025.
原文链接：
https://doi.org/10.1038/s41467-025-64916-8
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